Биологи нашли «живой» древний ретровирус в ДНК человека

. Генетики нашли в геномах нескольких тысяч человек обрывки более дюжины ретровирусов, попавших в нашу ДНК миллионы лет назад, и даже один полноценный геном вируса, который сохранился в нашем генетическом коде в первозданном виде, говорится в статье, опубликованной в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.

«Данный эндогенный ретровирус выглядит так, что его можно буквальным образом взять, вырезать и превратить в заразный патоген. Если это действительно так, то такой эксперимент был бы крайне интересен для нас, так как он позволил бы нам изучить следы эпидемии, поразившей человечество в далеком прошлом», — заявил Джон Коффин (John Coffin) из университета Тафтса в Медфорде (США).

Эндогенные ретровирусы — своего рода генетические паразиты, которые могут увеличивать число своих копий в геноме и встраивать их в новые места в хозяйской ДНК, приводя как к полезным, так и вредным мутациям. Гены этих вирусов составляют около 8% человеческого генома и являются частью некодирующей ДНК, которая не содержит «инструкций» для производства каких-либо белков.

Как выяснили Коффин и его коллеги, человеческая ДНК на самом деле содержит в себе горзадо больше следов ретровирусов, чем мы считали ранее, сравнив и проанализировав структуру геномов у примерно 2,5 тысяч людей из разных стран мира. В их число входили и жители Африки, чьи предки никогда не покидали «колыбели человечества» и не смешивались с неандертальцами или денисовцами.

Сравнение геномов разных людей помогло ученым найти те ретровирусы, которые присутствуют  в ДНК не всех людей, а лишь некоторой части человечества. Их число оказалось необычно большим – в общей сложности группа Коффина нашла 19 фрагментов ранее неизвестных эндогенных ретровирусов из семейства HERV-K, а также один фактически полноценный вирус в «женской» Х-хромосоме.

Ученые пока не знают, что делали вирусы, оставившие эти следы, так как обрывки их геномов слишком сильно повреждены и содержат в себе слишком много повторов для того, чтобы раскрыть функции их генов и ДНК. С другой стороны, встроенный вирус Xq21.33 обладает всеми нужными компонентами для его размножения  — генами, отвечающими за синтез белков его оболочки, встройку в ДНК жертвы и самокопирование.

Он является лишь вторым подобным примером «живого» вируса в нашей ДНК – другим примером этого является провирус K113, присутствующий в геноме примерно четверти всех людей на планете. Изучение этих вирусов, как надеются ученые, поможет нам понять, чем болели наши предки, как они смогли победить эти вирусы и как мы можем использовать эти «уроки» для борьбы с ВИЧ и другими современными ретровирусами.